Τους 51 Δήμους σε 20 Περιφερειακές Ενότητες που επηρεάζονται ή βρίσκονται σε υψηλό κίνδυνο από τον ιό του Δυτικού Νείλου, προσδιόρισαν οι υπεύθυνοι του ΕΟΔΥ.

Ως επηρεαζόμενες περιοχές ορίζονται οι Δήμοι με πρόσφατη καταγραφή τουλάχιστον ενός κρούσματος λοίμωξης από ιό Δυτικού Νείλου σε άνθρωπο κατά την τρέχουσα περίοδο.

Ως υψηλού κινδύνου περιοχές ορίζονται οι Δήμοι στους οποίους δεν έχει καταγραφεί κρούσμα σε άνθρωπο κατά την τρέχουσα περίοδο μετάδοσης (μέχρι στιγμής), αλλά συνδυάζονται παράγοντες κινδύνου για επικείμενη μετάδοση του ιού σε ανθρώπους και καταγραφή κρουσμάτων (εγγύτητα σε επηρεαζόμενες περιοχές/ γεωμορφολογικά δεδομένα, τρέχοντα και ιστορικά επιδημιολογικά δεδομένα της λοίμωξης, διαθέσιμα δεδομένα επιτήρησης της κυκλοφορίας του ιού σε κουνούπια/ζώα, στην ευρύτερη περιοχή).

Οι περιοχές αυτές είναι οι εξής:

• Περιφερειακή Ενότητα Λάρισας: Δήμοι Λαρισαίων, Κιλελέρ, Αγιάς, Ελασσόνας, Τεμπών, Τυρνάβου, Φαρσάλων.
• Περιφερειακή Ενότητα Καρδίτσας: Δήμοι Καρδίτσας, Παλαμά, Σοφάδων, Λίμνης Πλαστήρα, Μουζακίου.
• Περιφερειακή Ενότητα Τρικάλων: Δήμος Φαρκαδόνας.
• Περιφερειακή Ενότητα Λευκάδας: Δήμος Λευκάδας.
• Μητροπολιτική Ενότητα Θεσσαλονίκης: Δήμοι Λαγκαδά, Βόλβης, Παύλου Μελά, Θέρμης, Θερμαϊκού, Νεάπολης - Συκεών, Ωραιοκάστρου, Χαλκηδόνος, Πυλαίας - Χορτιάτη.
• Περιφερειακή Ενότητα Χαλκιδικής: Δήμοι Αριστοτέλη, Κασσάνδρας, Σιθωνίας, Πολυγύρου.
• Περιφερειακή Ενότητα Σερρών: Δήμοι Σερρών, Εμμανουήλ Παππά, Σιντικής, Βισαλτίας, Ηράκλειας.
• Περιφερειακή Ενότητα Πέλλας: Δήμοι Σκύδρας, Πέλλας.
• Περιφερειακή Ενότητα Αχαΐας: Δήμοι Δυτικής Αχαΐας, Αιγιαλείας.
• Περιφερειακή Ενότητα Θεσπρωτίας: Δήμος Ηγουμενίτσας.
• Περιφερειακή Ενότητα Ημαθίας: Δήμοι Αλεξάνδρειας, Βέροιας.
• Περιφερειακή Ενότητα Κιλκίς: Δήμος Παιονίας.
• Περιφερειακή Ενότητα Ροδόπης: Δήμοι Αρριανών, Μαρωνείας - Σαπών.
• Περιφερειακή Ενότητα Αργολίδας: Δήμοι Άργους - Μυκηνών, Ναυπλιέων.
• Περιφερειακή Ενότητα Νοτίου Τομέα Αθηνών: Δήμος Καλλιθέας.
• Περιφερειακή Ενότητα Πιερίας: Δήμος Πύδνας - Κολινδρού.
• Περιφερειακή Ενότητα Έβρου: Δήμοι Ορεστιάδας, Αλεξανδρούπολης.
• Περιφερειακή Ενότητα Δράμας: Δήμος Δράμας.
• Περιφερειακή Ενότητα Ξάνθης: Δήμος Τοπείρου.
• Περιφερειακή Ενότητα Φθιώτιδας: Δήμος Λοκρών.